论文查重软件支持跨语言查询的实现原理是通过内置的多语言识别技术，可以识别和比对多种语言的文本。当用户上传包含不同语言的论文时，查重软件会自动识别文本中的语言，并进行相应的跨语言查重。在比对过程中，软件会自动识别不同语言的相似度，提供全面的查重结果。同时，用户也可以在软件设置中指定需要进行跨语言查重的语种，以满足不同的需求。

除了内置的多语言识别技术，一些先进的论文查重软件还支持人工干预，用户可以手动指定需要进行跨语言查重的语种，提高查重的准确性。另外，一些跨语言查询功能还支持对翻译文本的查重，即用户可以上传需要翻译的文本，软件会自动进行翻译并进行跨语言查重。这些功能的实现，大大提高了论文查重软件在跨语言查重方面的应用价值。